服务介绍  Service Introduction

      长链非编码RNA（long non-coding RNA，LncRNA）是一类长度超过 200 nt ，不编码蛋白质的RNA分子。通过与 DNA、RNA 或蛋白质结合，在表观遗传、 转录及转录后等水平调控基因的表达，从而普遍参与动植物的各种生理学过程。lncRNA 测序是研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有 lncRNA 和 mRNA，并根据已知数据库进行详细注释。

实验流程  Experimental Procedures

分析流程 Technical Procedures

样品要求  Sample Requirements

实验周期 Turnaround Time

      Illumina Novaseq6000，PE150，45 个自然日，测序量：12 Gb Rawdata。     

结果展示 Overview of Result

全基因组覆盖度分布图，每条染色体（scaffold）偏红色区域为平均深度高的区域，偏蓝色为低的区域，没有覆盖的区域为白色。

样品PCA图，如果两个样本距离越远，则说明两个样本 reads 分布的差异越大。反之，则说明相应样本 reads 整体分布模式越接近。所以，PCA 分析常用于评估样本重复性的好坏。

差异基因火山图，可直观显示表达差异显著性的整体分布情况，能够得到在不同处理或不同表型的样品之间表达显著差异的lncRNA，这些lncRNA对应的基因或者靶向的基因可能在不同处理或者不同表型中发挥功能。

差异基因聚类热图，差异基因聚类分析用于判断基因在不同实验条件下调控模式的聚类模式。根据样品基因表达谱的相近程度，将基因进行聚类分析，直观地展示基因在不同样品（或是不同处理）中的表达情况，由此获取生物学相关信息。

差异基因 KEGG 富集通路图，得到差异表达的lncRNA和mRNA之后。针对lncRNA，对lncRNA靶基因进行GO和KEGG富集分析和蛋白网络互作分析；